本发明属于螺旋藻深加工技术领域，公开了一种螺旋藻小分子肽饼干及制备方法，采用破壁技术以螺旋藻泥经物理破壁、脱腥、脱色、脱重金属、复合酶解、脱盐浓缩、喷雾干燥提取小分子肽，再经过配料—和面、发酵、轧面、成型、焙烤、刷油、冷却及包装制成一种螺旋藻小分子肽烘焙饼干。本发明通过添加即溶螺旋藻粉、小麦粉等降低了成本，改善了口感更加适合作为大众人群的食品，更具有广阔的消费市场，解决了螺旋藻食品生产加工技术瓶颈问题，提高了螺旋藻需求量，解决螺旋藻原料生产供大于求的现状，提高了农民养殖螺旋藻的积极性，对促进螺旋藻养殖加工业发展产生重大影响，是开发螺旋藻资源开辟一条新的途径，产品营养实用，市场前景好。