本发明公开了一种基于HE染色图像的细胞分割方法及装置，包括：接收用户上传的HE染色图像，并对HE染色图像进行预处理，获得第一图像；按照预设的计算方法，根据第一图像和多个不同的第一系统参数，计算得到对应的耦合结果图像；其中，所有第一系统参数是根据第一图像，对随机生成的若干个初始系统参数训练而获得的；接收用户输入的分割图像参数，并结合耦合结果图像和HE染色图像，计算得到HE染色图像对应的分割图像。本发明通过对HE染色图像进行预处理得到第一图像，并利用第一图像对系统参数进行训练，以适应不同染色风格的HE染色图像。同时，本发明还能够接收用户输入的图像参数，对待输出图像进行调整，得到并输出分割图像。