本发明公开了基于自监督学习的胃癌分子亚型分类方法及装置，方法包括下述步骤：获取胃癌病理图像测试集；对所述胃癌病理图像测试集中的胃癌测试病理图像分别进行预处理得到测试图像块集；将所述胃癌测试图像块根据放大倍数输入到对应的训练好的特征提取器中，得到初始测试特征向量集；对得到的胃癌测试图像块特征进行融合，输入到训练好的多层感知机分类模型中得到所述胃癌测试图像块集分类结果；对所述测试图像块集分类结果根据所属胃癌病理图像进行结合，得到所述胃癌病理图像测试集胃癌分子亚型分类结果。本发明能够充分利用病理图像的多尺度信息以及切割成图像块后图像块周围区域特征信息，同时利用其他大量无标签病理图像数据帮助提高模型性能。