本发明介绍了一种真实珊瑚砂颗粒离散元模型的构建方法，其包括；S1、对砂颗粒的堆积体进行扫描；S2、获取单个砂颗粒的三维表面形貌，形成砂颗粒的三角网格；S3、建立三维背景网格节点集，并将砂颗粒的三角网格放置在三维背景网格节点集中；S4、建立扫描平面；S5、使用扫描平面进行扫描，获取砂颗粒的坐标集合；S6、根据砂颗粒的坐标集合构建真实珊瑚砂颗粒离散元模型。本申请对颗粒模型进行剖分，采用边界搜索算法和射线算法对边界点位进行确定，不限制颗粒的形状，对于凹多边形也有较好的效果，能够还原构建真实模型，同时通过调节扫描步长实现模型的精度控制，提升计算速度，除建立砂颗粒离散元模型外，还可实现结构体模型的建立。