本发明属于脂肪组织改性的技术领域，具体涉及一种自体脂肪酸蛋白乳的制备方法以及应用。取脂肪组织，去除脂肪的条索结构，静置去除肿胀液或者离心去除水分后，将脂肪组织与活性组分混合得到组织混合物，将组织混合物进行研磨处理，再进行超声乳化处理，得到乳糜状产品，即得到自体脂肪酸蛋白乳；所述活性组分包括PRP‑富血小板血浆、谷胱甘肽或传明酸一种或以上的混合物。使得脂肪组织的细胞结构遭到破坏，不存在完整的细胞结构，经研磨和乳化操作，使得脂肪组织细胞内的活性物质得到释放，得到一种水、脂肪酸和蛋白质的混合物，即获得细胞外基质结构较为完整的自体脂肪酸蛋白乳，释放多种脂肪组织细胞内的生长因子，从而进行组织修复。