本发明公开了一种跨模态隐私语义检索方法、系统及存储介质，涉及数据处理技术领域，方法包括：客户端基于多模态联合表征模型对多模态数据进行语义特征提取得到语义表征向量，对语义表征向量进行加密获得密态语义表征向量；服务器接收客户端发送的密态语义表征向量，根据预设检索索引表，确定与密态语义表征向量关联的语义检索关键词，在预设检索索引表中查找与语义检索关键词对应的数据地址，获得密态语义检索结果，并将密态语义检索结果发送至客户端；客户端对密态语义检索结果进行解密和显示。本发明解决了现有技术存在检索准确性较低的问题，实现了在保障查询隐私和存储数据隐私的前提下，提升语义检索结果的准确性的效果。