本发明提供一种氮化硅陶瓷换热器及其制备方法、应用，所述制备方法包括以下步骤：1)构建换热器实体部分三维模型及换热器内流道填充部分三维模型，采用多材料3D打印系统，打印得到含有实体部分和流道填充部分的打印件；换热器实体部分的打印原料为膏料；流道填充部分的打印原料为固化树脂；实体部分及流道填充部分互补；2)热分解打印件去除所述流道填充部分，得到换热器生坯；3)烧结换热器生坯，得氮化硅陶瓷换热器。本发明采用多材料3D打印系统打印得到含有实体部分和流道填充部分的打印件，然后直接去除流道填充部分，烧结后得到氮化硅陶瓷换热器，无需额外的清洗步骤，避免流道内膏料无法去除，造成流道堵塞。