本发明公开了一种原花青素微胶囊及其制备方法，以原花青素为原料，将其溶液与海藻酸钠溶液混合，将混合液滴注进入一定浓度的乳酸钙与乳清蛋白的混合溶液中。在海藻酸钠与钙形成海藻酸钙囊壳的同时，小分子蛋白‑乳清蛋白与原花青素发生络合，减少原花青素的渗出，增强其在微胶囊中的稳定性。静置一段时间后，将微胶囊加入壳聚糖溶液，在现有微胶囊外再加裹一层壳聚糖外壳。之后自然干燥得到壳聚糖/海藻酸钙/乳清蛋白‑原花青素微胶囊。这种微胶囊能显著提高原花青素的稳定性。而且在模拟消化时，微胶囊中的原花青素缓慢释放，生物可接收率高，食糜对其稳定性影响小。