本发明属于电力系统自动化领域，公开了一种电网运行风险预测方法、系统、计算机设备及存储介质，包括：根据电网的当前新能源接入梯度等级以及待预测电网运行安全评价指标，从预设的若干电网运行风险预测模型中，选取新能源接入梯度等级与当前新能源接入梯度等级相同，且电网运行安全评价指标与待预测电网运行安全评价指标相同的电网运行风险预测模型，得到目标电网运行风险预测模型；根据待预测电网运行安全评价指标，确定电网的当前预测用特征变量并输入目标电网运行风险预测模型，得到预测值并根据预测值确定电网运行风险。通过新能源接入梯度等级划分以及电网运行安全评价指标与预测用特征变量的对应，有效提升电网运行风险的预测准确性。