本申请涉及一种蛋白质的序列设计方法、蛋白质的结构设计方法、装置及电子设备。该序列设计方法包括：获取具有预设长度的起始序列和对应的角度距离分布；其中，起始序列为包括目标基序的序列或随机序列；以起始序列开始对单个氨基酸进行随机突变，及依序根据前一次突变后的氨基酸序列及对应的角度距离分布对单个氨基酸进行当前随机突变，并分别按照预设损失函数根据对应的角度距离分布确定各突变后的氨基酸序列对应的变化值；选取变化值符合预设条件的氨基酸序列作为优选序列。本申请提供的方案，能够有效地获得优选序列，提高研发效率和降低研发成本。