基于改进遗传算法的多路径地形匹配方法，利用惯性导航系统指示的初始航迹位置与多波束测深系统的测深数据，结合先验水下地形图，确定载体在地形图上的绝对位置。根据惯导指示航迹与真实航迹之间的仿射变换模型，确定旋转量，缩放量和横向纵向平移量为待优化参数，利用改进遗传算法对待优化参数进行求解，为加快算法收敛速度，降低算法陷入局部最优的可能性，利用正余弦算法对每代种群的精英个体进行优化，提高精英个体质量。结合多波束测深数据特点，选择多条水深序列进行匹配，提高相似地形处的匹配定位精度。本发明在初始位置误差较大的情况下仍能成功实现匹配定位，并且在地形相似处有较高的定位精度。