本申请实施例提供一种基于惯性测量单元的时间数据同步方法及系统，涉及数据同步技术领域。该基于惯性测量单元的时间数据同步方法包括：获取定位模块发送的触发信号；可以实现将定位模块的时间信息与惯性测量单元的数据进行时间数据同步的技术效果。根据所述触发信号中断处理进程并开启计数器计时；获取芯片模块发送的协调世界时数据，所述协调世界时数据与所述触发信号在时间上对齐；在获取所述协调世界时数据后结束所述计数器计时，根据所述计数器计时生成延时数据；根据所述协调世界时数据和所述延时数据生成同步时间数据。该基于惯性测量单元的时间数据同步方法可以实现将定位模块的时间信息与惯性测量单元的数据进行时间数据同步的技术效果。