本发明实施例提供一种动态的滤芯相容性测量方法及装置，所述方法包括：构建滤芯测试管路；获取介质属性，调节测试介质的属性；根据介质流量开启出液阀门及进液阀门，开启取样阀门，获取测试介质作为空白样；调节出液阀门及进液阀门，使测试介质流入介质储罐，装入待测滤芯；根据介质属性调节测试介质的属性，根据介质流量开启出液阀门及进液阀门，开启取样阀门，获取测试介质作为测试样；获取空白样与测试样中的介质数据，得到待测滤芯的相容性测量结果。采用本方法能够通过动态的考察滤芯装入前后管路中介质的清洁程度，能够安全、便捷地评价滤芯在核电多种工况中的介质相容性，并且还原了核电工况，提高了测试结果的可靠性。