本发明公开了一种谷粉糕点食品微生物发酵装置及其发酵方法，涉及微生物发酵技术领域，为解决现有的微生物发酵装置在空气填充的时候多数都是从单一的方向进行输送，导致发酵不均匀且效率低的问题。所述发酵罐的上端设置有顶罐，所述发酵罐的下端设置有底罐，且顶罐和底罐与发酵罐为一体结构，所述发酵罐的内部设置有转动套，所述转动套的内部设置有空心腔，且空心腔与转动套为一体结构，所述空心腔的内部设置有出气管，所述出气管的表面设置有第一出气孔，且第一出气孔与出气管为一体结构，所述转动套的表面设置有第二出气孔，且第二出气孔与转动套为一体结构，所述转动套的外部设置有搅拌叶，所述搅拌叶的中心处设置有弹性带。