本申请涉及食品生产的领域，尤其是涉及一种全自动食品杀菌生产线及其生产工艺，全自动食品杀菌生产线包括支架，支架上转动连接有链板式传送带，链板式传送带的链板上开设有多个托杯口，还包括上料箱和回收箱，支架固定连接有安装架，安装架沿竖直方向滑动连接有第一面板和第二面板且设置有升降件；第一面板固定连接有第一管道，第一管道与上料箱之间设置有高压泵，第一管道设置有多个喷洒管，喷洒管上设有多个雾化喷头；第二面板固定连接有第二管道，第二管道连接有鼓风机，第二管道固定且连通有多个吹气管。本申请朝向塑料杯的内壁喷洒酒精并风干酒精，具有对塑料杯内部进行杀菌消毒的效果，利于提高食品生产安全性能，节能环保。