本发明提供一种图像数据处理方法，应用于口腔扫描仪，口腔扫描仪内置有图像数据采集单元和异构可编程逻辑芯片；所述方法包括：通过图像数据采集单元采集并发送多个口腔图像数据；通过异构可编程逻辑芯片：接收并解析多个口腔图像数据，得到多个并行口腔图像数据；处理多个并行口腔图像数据，并得到目标图像数据，其中，目标图像数据为预设图片格式的图像数据；及将目标图像数据发送至服务器。口腔扫描仪上集成图像数据采集单元、图像数据处理单元、异构可编程逻辑芯片等多个硬件模块；集成化程度高；通过异构可编程逻辑芯片能够快速处理口腔图像数据并发送，有效提高数据处理和传输的效率。