本发明公开一种组培瓶全自动清洗机，包括清洗配合转筒、摆瓶输送轨道、倾斜振动台、翻瓶输出轨道和冲洗组件。清洗配合转筒包括旋转筒体和多个瓶体装载部，各瓶体装载部包括多个瓶笼。摆瓶输送轨道具有多个送料轨道槽，各送料轨道槽分别延伸至清洗配合转筒沿轴线方向的不同位置上。倾斜振动台的一端延伸至各送料轨道槽。翻瓶输出轨道设置于清洗配合转筒背离摆瓶输送轨道的一侧，翻瓶输出轨道包括台面和多个出料轨道槽，各出料轨道槽的一端延伸至清洗配合转筒，各出料轨道槽的另一端延伸至台面。冲洗组件至少包括多个喷头。本申请的组培瓶全自动清洗机能够自动执行组培瓶的输送和清洗任务，机械化程度高，不需要人员持续辅助操作。