本发明提出了一种基于关联路径的过饱和关键交叉口群协调控制方法及系统，确定关键交叉口，与所有相邻交叉口一起构建子区的关键交叉口群；计算关键交叉口群公共周期；分配各关联交叉口各相位的初始绿灯时间；确定关键交叉口各相位需要的绿灯时间；利用多关联路径协调控制策略协调关键交叉口配时；判断关键交叉口与各关联交叉口通行能力是否收敛，若收敛或已达最大迭代次数，输出关键交叉口群内所有交叉口的最终配时结果；若不收敛，结合各路径下游交叉口关联相位绿灯时间扩展约束条件扩展下游关联相位绿灯时间，更新关联交叉口配时，重新迭代计算。本发明有效减少了路网排队滞留现象，同时在过饱和情况下可大大减少延误、停车次数与等待时间。