本发明公开了一种微针阵列酶复合电极及其制备方法，属于生物医学技术领域。所述的微针阵列酶复合电极，包括：衬底；阵列于衬底上的空心微针；位于空心微针外侧面的参比电极；位于空心微针中部的微针中部的对电极；位于参比电极、对电极之间的酶工作电极；所述参比电极、对电极、酶工作电极之间设有阻隔层。通过在空心微针外侧面设置参比电极，在空心微针中部设置对电极，在参比电极、对电极之间设置酶工作电极，使所述的酶工作电极与对电极距离近，能够减少工作电极与对电极之间的电阻；同时，通过缩短电极间的距离，能够减少分子在两个电极之间的扩散距离，能够有效的提高检测电流灵敏度，从而实现高灵敏度的局部分析物浓度测定。