本发明公开的一种海洋鱼生物肽的制备方法，包括以下步骤：1)取新鲜海洋鱼鱼肉，加水制成鱼浆液；蒸煮20‑30分钟，冷却，得到匀浆液；2)将上述匀浆液pH调节至5‑7，加入蛋白酶和酶激活剂，置于48‑52℃下进行酶解，灭酶活得到酶解液；3)将酶解液经陶瓷膜微滤，后经有机超滤膜进行分级纯化，再经纳滤膜进行纳滤；4)将步骤3)所得滤液用冷冻干燥法干燥后制得初步的海洋鱼生物肽；5)对步骤4)所制得的初步的海洋生物肽去苦和去腥。本发明属于海洋鱼低聚肽制备技术领域，具体是一种对海洋鱼生物肽进行去苦和去腥，提升口感，得到的海洋鱼生物肽性质稳定，活性成分含量高，同时该制备方法工艺过程简单、操作容易、成本低的海洋鱼生物肽的制备方法。