本发明涉及一种改性羧甲基壳聚糖季铵盐及其制备方法，所述改性羧甲基壳聚糖季铵盐以O‑羧甲基壳聚糖、三羟乙基烯丙基季铵盐为原料通过反相乳液聚合法聚合反应，制得三羟乙基烯丙基季铵盐接枝羧甲基壳聚糖。本发明所用的壳聚糖、三羟乙基烯丙基季铵盐易得到、易降解、生物相容性好、成本低。本发明采用的反相乳液聚合法，在水和煤油分别作为水相体系和油相体系的条件下进行反应，相比现有技术的水溶液聚合法、通氮气，反应条件简单，温度低，时间短，能耗少。本发明合成的改性羧甲基壳聚糖季铵盐，可与水中微粒起电中合反应和吸附架桥作用，使体系中的微粒脱稳、絮凝而有助于沉降和脱水，同时具有一定的杀菌抗菌性、保湿性。