本申请公开了一种基于分布式协作的隐私计算方法及系统，属于数据处理技术领域。所述方法包括：每个隐私计算一体机向控制器注册自身存储的数据集；SDK通过控制器向n个隐私计算一体机申请使用数据集；在n个隐私计算一体机同意SDK使用数据集后，SDK将开发的隐私计算应用发送给控制器，隐私计算应用中包含对n个隐私计算一体机中的数据集的引用；控制器对隐私计算应用进行分解，将得到的计算任务分别发送给n个隐私计算一体机；每个隐私计算一体机根据自身存储的数据集对计算任务进行计算，通过控制器将得到的计算结果发送给SDK。本申请既可以保证数据安全，也可以使得应用开发端上的应用开发更加轻量化。