本发明公开了一种集成电路数字后端ECO方法、系统及计算机存储介质，该方法包括后端设计工具根据原设计数据库及逻辑ECO后的网表，得到管脚列表及原线网名列表；后端设计工具根据逻辑ECO后的网表，将原设计数据库中需要更改的管脚及所述管脚的更名对象的原线网名均改为新线网名，得到新设计数据库，所述更名对象包括金属形状及过孔；得到新设计数据库；进行ECO布线。本发明能够快速高效地实现第一金属层及第一过孔层的复用，以此来减少ECO改动层数，提高ECO的效率，辅助降低ECO的成本，且不受芯片复杂程度的限制，准确度高，尤其适合芯片比较复杂、管脚较多、连接逻辑较复杂的场景。