本实用新型公开了一种硫自养反硝化脱氮除硫反应器，涉及污水生物处理装置领域，包括反应器主体；进水口；硫自养反硝化腔；集气腔；滤布；出水口；排气口；具有搅拌杆的搅拌机构；具有过滤板的遮挡机构。本实用新型通过设置搅拌机构，当电机运作时会带动连接轴进行转动，此时连接轴会通过矩形卡块带动矩形连接块进行转动，由此便可使搅拌杆进行转动，搅拌杆在进行转动时会带动连接管进行转动，此时连接管便会在进行转动的同时沿着往复丝杆进行上下移动，以此来使搅拌杆在进行转动的同时进行上下移动，从而增加了设备的搅拌范围，以此来使自养反硝化颗粒污泥与废水充分接触，从而增加了废水的反应效率。