一种基于空间结构的蛋白质相互作用预测方法
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摘要
本发明涉及一种基于空间结构的蛋白质相互作用预测方法，该方法包括如下步骤：(1)采集蛋白质三维空间结构标准数据；(2)构建蛋白质相互作用正、负样本数据集；(3)提取正、负样本数据集中的蛋白质三维空间结构标准数据的结构矩阵；(4)构建用于蛋白质相互作用预测的深度学习模型；(5)将正、负样本集中的结构矩阵输入至深度学习模型，训练深度学习模型；(6)获取目标蛋白质三维空间结构数据；(7)提取目标蛋白质三维空间结构数据的结构矩阵；(8)深度学习模型预测得到目标蛋白质相互作用的概率。与现有技术相比，本发明蛋白质三维空间结构数据能够提高模型对蛋白质相互作用的识别能力，大大提高蛋白质相互作用的预测准确性。
基本信息
专利标题 ：
一种基于空间结构的蛋白质相互作用预测方法
专利标题（英）：
暂无
公开（公告）号 ：
CN110853702A
申请号 ：
CN201910979313.9
公开（公告）日 ：
2020-02-28
申请日 ：
2019-10-15
授权号 ：
CN110853702B
授权日 ：
2022-05-24
发明人 ：
张利达雷雨洪剑伟郑存俭赵佳薇
申请人 ：
上海交通大学
申请人地址 ：
上海市闵行区东川路800号
代理机构 ：
上海科盛知识产权代理有限公司
代理人 ：
丁云
优先权 ：
CN201910979313.9
主分类号 ：
G16B15/00
IPC分类号 ：
G16B15/00 G16B20/30 G16B40/00
IPC结构图谱
G
G部——物理
G16
特别适用于特定应用领域的信息通信技术
G16B
生物信息学，例如特别适用于计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关数据处理的信息与通信技术
G16B15/00
特别适用于分析二维或三维分子结构，例如结构或功能关系、结构排序的ICT
法律状态
2022-05-24 ：
授权
2020-03-24 ：
实质审查的生效
IPC(主分类) : G16B 15/00
申请日 : 20191015
申请日 : 20191015
2020-02-28 ：
公开
注：本法律状态信息仅供参考，即时准确的法律状态信息须到国家知识产权局办理专利登记簿副本。
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