本实用新型公开了自动荧光体式显微镜，包括工作台，工作台顶端的一侧固定设有立柱，立柱的表面处滑动连接有方形块，方形块的一侧固定设有倍镜架托，倍镜架托顶端的中部贯穿安装有倍镜体，倍镜体的顶端接口处固定连接有CCD相机，工作台的背面固定连接有万向臂，万向臂的一端通过万向球头活动连接有平板电脑，工作台顶端的一侧通过开设有的凹槽安装有紫外光源，本实用新型的有益效果是通过设有的吸盘和橡胶桩，提高了工作台的稳定性，提高测试的精度，通过设有的CCD相机和平板电脑，通过CCD相机直接将光信号转化为电信号，直接传到平板电脑中进行分析处理，避免使用者直接用眼观看记录，造成视觉疲劳，影响测量结果。