本发明公开了大蒜蒜氨酸提取用大蒜微波高火灭酶装置及其使用方法，包括支撑机构，以及安装在所述支撑机构的内部用于传送大蒜的输料机构；所述支撑机构包括支架、支脚，所述支架的下端四角安装有所述支脚，所述支架的前端安装有控制箱，所述支架的上端安装有箱体，所述箱体与所述支架通过焊接连接，所述箱体的四个表面上均安装有微波发生器，所述微波发生器与所述箱体通过螺栓连接，所述箱体的顶端安装有进料斗。本发明通过输料机构的特殊结构大大延长了微波灭酶的时间，无需控制传输的速度，就可以实现对大蒜充分灭酶处理，自动化程度高，省时省力，确保了后续大蒜处理的质量。