本发明涉及光学镜片检测技术领域，公开了一种透过率测试方法及透过率测试系统，以解决相关技术中利用测试仪器测试光学镜片透过率时存在测试误差的技术问题。所述透过率测试方法包括：获取测试仪器未放入待测样品时的光强信息，记为参照光强；将所述待测样品放入所述测试仪器的测试光路中，调整所述待测样品的摆放角度以使其光轴的角度与测试光源的偏振角度相等；获取所述测试仪器放入所述待测样品后的光强信息，记为测试光强；根据所述参照光强和所述测试光强，计算所述待测样品的透过率。本发明可用于光学镜片的透过率测试。