本发明提供了一种基于SOM聚类模型的数学表达式的聚类方法。该方法通过对MathML格式的数学表达式进行解析，将数学表达式处理为表达式树形式，得到表达式各元素层次位置和子节点信息；再从表达式自身的结构特征出发，为表达式中各元素分配权重；接着使用SOM神经网络对数学表达式样本集进行训练，得到相应的SOM聚类模型；最后采用SOM聚类模型实现对数学表达式的聚类。本发明使用基于模型的方法中的SOM神经网络对数学表达式进行聚类，该网络模拟人类大脑的自组织特征映射功能，网络结构简单，表达式的特征可以使用权重表示，能够很好地与神经网络输入神经元契合，将其作为输入数据可以得到很好的聚类效果。