本发明提供了一种基于移动设备的自动驾驶车辆叫停方法，基于移动设备的自动驾驶车辆叫停方法包括：移动设备获取用户输入的权限信息；移动设备获取用户输入的车牌信息；移动设备根据车牌信息生成停车指令；移动设备根据权限信息为停车指令添加权限；移动设备向具有车牌信息的自动驾驶车辆发送停车指令；自动驾驶车辆获取停车指令；自动驾驶车辆判断权限和停车指令是否符合预设的条件；当权限停车指令符合预设的条件时，自动驾驶车辆执行停车指令控制自动驾驶车辆停车。此外，本发明提还供了一种车辆叫停系统。上述基于移动设备的自动驾驶车辆叫停方法及车辆叫停系统，实现了自动驾驶车辆在在行驶异常时，相关人员能够及时叫停车辆的效果。