本实用新型公开了一种全自动蛋液巴氏杀菌系统，包括电源模块，所述电源模块的输出端单向电性连接有中央处理器，所述中央处理器的输出端单向电性连接有送料机，所述中央处理器的输出端单向电性连接有杀菌模块，所述杀菌模块的输出端通过管道连通有杀菌箱，所述杀菌箱的内腔设置有温度传感器，所述温度传感器与中央处理器双向电性连接，所述中央处理器的输出端单向电性连接有出料机，所述中央处理器的输出端单向电性连接有观察模块，所述送料机与杀菌箱之间连接有轨道。本实用新型通过杀菌模块、中央处理器、杀菌箱、送料机、观察模块和出料机的配合，解决了蛋液比较敏感，温度过高或者过低都会破坏蛋液结构的问题。