本实用新型公开了一种微生物菌种子发酵罐，包括发酵罐本体、搅拌组件和内壁清洗机构，发酵罐本体的底部设置有罐体底部，罐体底部和发酵罐本体之间通过焊接方式固定连接，且罐体底部的形状设置为半球形空腔结构，发酵罐本体的顶部设置有搅拌组件，搅拌组件和发酵罐本体之间固定连接，搅拌组件包括密封盖、驱动电机和搅拌轴，密封盖的顶端设置有驱动电机。通过设置的发酵罐本体、搅拌组件和内壁清洗机构之间的相互配合，从而可以对发酵罐本体内的微生物菌种子进行搅拌，从而可以提高微生物菌种子的发酵效率，并且还可以对发酵罐本体的内侧壁进行清洁，从而可以防止在发酵的过程中出现生物菌的种子与营养液脱离的情况发生。