本发明公开一种基于模板匹配的自适应运动想象脑机接口方法与系统，包括以下步骤：先基于运动想象的脑电信号预处理与特征提取及优化，再基于自适应规则的模板匹配分类模型设计；本发明在采集到脑电信号后，先对脑电信号进行预处理，再对脑电信号进行特征提取和优化，接下来利用训练数据，以及外界辅助信息，并融合自适应规则，获得不同运动想象信号的模板信息，进而建立基于模板匹配的脑电信号分类模型，识别运动想象意图，通过基于模板匹配的自适应规则建立运动想象脑电信号识别模型，从而使得运动想象脑机接口在长期使用中都能稳定识别运动想象意图，同时为上肢运动解码的研究提供了新的思路，为人机协同交互的进一步研究提供了基础。