本发明公开了一种基于深度学习的ADR辅助决策系统，该系统包括药物数据库模块，用于获取并存储药品信息及相关的药物不良反应信息；CHPS药品评价模块，用于在CHPS系统的基础上并导出完善后的药物不良反应数据；深度学习模块，用于学习自CHPS药品评价模块导出的药物不良反应数据；辅助评价及风险预警模块，用于利用深度学习模块进行比对输入后的某种药物信息；用药决策模块，用于通过辅助评价及风险预警模块后，进行用药决策判断，给出是否用药信息；反馈模块，用于将用药后的患者相关体征数据及用药的用量、频率数据反馈至深度学习模块性；该系统在提高、完善药物不良反应数据的同时，基于深度学习，可对用药做出决策分析以及风险管理。