本发明的目的是为了解决目前铁基催化剂活化过硫酸氢盐反应过程中存在氧化剂稳定性差和铁基催化剂制作工艺复杂、费用较高的问题，提供一种去除水中抗生素的方法。本方法步骤如下：1)取粒度≤50μm的天然黄铁矿并利用酸活化，干燥，制得活化的黄铁矿颗粒；2)将黄铁矿颗粒加入到含有过硫酸氢盐和抗生素的溶液中，搅拌，促进充分反应，同时添加直流电源辅助黄铁矿活化过硫酸氢盐的氧化反应。本发明采用来源丰富、价格低廉、无毒无害的纯天然的黄铁矿同时辅助添加电化学活化过硫酸氢盐，以提升过硫酸氢盐高级氧化技术在处理污水中抗生素的应用价值。