本发明公开了一种服务器系统的冷却系统的控制方法、装置及服务器系统，服务器系统包括多个服务器，冷却系统配置多个冷却单元，每一冷却单元对应一个服务器，该方法中首先获取每一服务器的多个第一类运行参数，第一类运行参数能够表示出服务器的温度，然后获取每一冷却单元的第二类运行参数和第三类运行参数，第二类运行参数能够表示出冷却单元的压力变化，第三类运行参数能够表示出冷却单元是否发生故障；根据第一类运行参数的第一参数范围、第二类参数的第二参数范围和第三类参数的第三参数范围，确定是否针对冷却单元进行报警控制。由此，将冷却单元和服务器联动起来，避免服务器和冷却单元误报引起不必要的关机，有效提升服务器系统使用效率。