本实用新型公开了一种具有防污染结构的荧光成像装置，包括成像主体、调节组件和成像组件，调节组件，其设置在所述成像主体的内部上方，成像组件，其安装在所述调节组件的中部。该具有防污染结构的荧光成像装置，与现有的装置相比，通过铰链，可以方便将箱门进行开关，从而可以在工作成像时，对内部环境进行密封隔离，从而避免外界的环境对成像产生影响，通过箱门表面的可视口，可以对内部的工作状态进行观察，通过活物箱，可以在对活物进行成像时进行放置，通过滑槽，可以在对其他物体进行成像时，方便将活物箱取下，从而使其他物品放置在托盘上，同时能够对活物箱进行清理，通过消杀灯，可以对装置使用后对内部进行杀菌。