本实用新型公开了一种控制器的散热结构，包括控制器固定底座、控制器、散热器，控制器设置于控制器固定底座上，控制器固定底座上设置有贯通孔，散热器包括依次连接的连接部、传递部、散热部，连接部与控制器相连接，传递部穿过贯通孔，散热部外露于控制器固定底座外。其中连接部与控制器连接，能够将控制器产生的热量传导到连接部上，从而依次通过传递部、散热部散发，而传递部穿过控制器固定底座上的贯通孔，能够将散热部置于控制器固定底座外，从而使得散热部不会局限在控制器固定底座的有限空间内，而是能够与电动两轮车的外部空间直接接触，在骑行过程中能够通过电动两轮车移动以及后轮滚动产生的风力来快速带走热量，大大提升了散热性能。