本发明涉及一种无人机集群多任务动态分配方法及系统，利用两层联盟的设计方法，首先以地面站为决策主体进行任务初始分配，然后以无人机为决策主体进行任务重分配，先获取并执行地面站任务分配结果，在发现任务变化或者本无人机所在联盟发生变化时，判断当前任务是否能带来最大收益，若不能带来最大收益了，那么寻找并加入最大的收益对应的联盟，同时每次转换任务便增加一次更新次数，结合每架无人机的更新次数判断对应的局部信息的准确性，从而能够充分考虑无人机在执行任务过程中的各种突发情况，有效解决了现有技术中无法考虑突发情况的问题。