本发明公开了基于FPN算法的生态生物识别方法，包括如下步骤：收集生态生物特征，将收集的生态特征进行收集分类，并建立分布式生态特征数据库；发起生态生物识别请求，根据请求在生态环境中采集生物图像数据；对采集的生物图像数据进行分析处理，并将分析处理后的生物图像数据进行存储；通过FPN算法对采集的生物图像数据进行目标检测；将得到的所需识别的生物图像数据与分布式生态特征数据库中的特征数据进行对比识别。本发明通过设置FPN算法，能够同时利用低层特征高分辨率和高层特征的高语义信息，通过融合这些不同层的特征达到预测的效果，并且预测是在每个融合后的特征层上单独进行的，大幅度提升了小物体检测的性能。