本发明提供一种海面测量系统、海面测量方法以及存储介质，应用了图像测量技术，对海啸等海面异常进行测量。包括：摄影单元，其通过设置于不同地点处的多个摄像机来同时拍摄包括同一海面区域的图像；波浪提取单元，其从通过多个摄像机同时拍摄到的各个图像中提取波浪；波浪对应单元，其针对由波浪提取单元提取出的各波浪，从通过多个摄像机同时拍摄到的各个图像中找出相同的波浪并进行对应；三维信息计算单元，其通过对由波浪对应单元对应起来的图像中的各波浪进行三维分析，来计算海面的高度和波浪的高度；以及海面异常有无判定单元，其基于由三维信息计算单元计算出的海面的高度和波浪的高度，来判定是否发生海面异常。