本发明提供了一种高分散二氧化硅的制备方法，所述制备方法包括如下步骤：混合硅酸钠水溶液与醇水混合液，得到初混液；混合改性有机溶液与初混液，得到混合液；所得混合液与酸液混合至pH值为6‑6.5，陈化，得到初沉液；混合引发剂与初沉液，滴加酸液调节pH值至4.5‑5，沉淀反应后进行固液分离，得到包覆改性二氧化硅；热处理包覆改性二氧化硅，得到所述高分散二氧化硅。本发明通过在硅酸钠水溶液中添加改性有机溶液，实现改性有机溶液中有机物对二氧化硅的包覆改性，避免二氧化硅沉淀过程中的过分聚集，从而使其兼具高比表面积的条件下，具有良好的分散性能。