本公开实施例提供一种料箱盘点方法、装置、调度设备、仓储系统及存储介质，该料箱盘点方法包括：生成盘点区域的盘点指令，并将所述盘点指令发送至至少一个盘点机器人，所述盘点指令用于控制所述至少一个所述盘点机器人对所述盘点区域进行盘点，以得到所述盘点区域的至少两组盘点数据，其中，所述盘点区域包括多个库位；接收所述至少两组盘点数据，其中，每组所述盘点数据分别包括一个料箱识别码队列；将各个所述料箱识别码队列取交集，得到交叉盘点队列；根据所述交叉盘点队列以及所述盘点区域的库存数据，判断所述盘点区域是否存在待检查库位，实现了交叉方式的批量盘点，以及基于盘点结果进行盘点区域异常判断，提高了盘点效率。