本发明公开了一种医疗命名实体识别模型训练方法、医疗命名实体识别方法及联邦学习系统。医疗命名实体识别模型训练方法包括：接收中心服务器发送的用于识别医疗命名实体的全局模型；基于本地的医疗文本标注数据训练全局模型，并计算得到对应的梯度数据；将梯度数据发送至中心服务器，以使中心服务器基于联邦学习系统接收的各个梯度数据对全局模型进行训练以得到新的全局模型，若该新的全局模型当前已收敛，则分发已收敛的全局模型；接收已收敛的全局模型；基于本地prompt模板对已收敛的全局模型进行本地化微调处理，以形成本地化医疗命名实体识别模型。本发明的技术方案实现了医疗数据的隐私保护和医疗命名实体识别模型本地个性化。