本发明提供了一种基于瓶颈注意力模块的遥感图像云检测方法及系统，属于遥感图像处理技术领域。该方法步骤如下：步骤1、获取并处理样本集；步骤2、搭建遥感图像云检测网络框架；步骤3、对遥感图像云检测网络进行迭代训练；步骤4、输出遥感图像云检测预测结果。检测系统包括样本获取模块、网络框架搭建模块、训练模块、输出模块四部分。本发明所构建的遥感图像云检测网络采用一种瓶颈注意力的结构，该结构结合了轻量化卷积，线性逆转残差结构，坐标注意力机制三者各自的优点，主要解决了网络采用轻量化卷积后，导致的特征量减少，精度下降等问题，实现了以低参数量和低运算量的云检测系统，达到更高精度的轻量型在轨云检测效果。