本发明为一种基于原型分割网络的小样本牙齿检测方法及存储介质，网络输入模拟图像和真实图像，两个样本输入网络在经过CNN特征提取之后会分别得到虚拟图像特征和和真实图像特征，模拟虚拟图像特征与Mask标签进行结合，之后经过NPR模块进行特征聚类，真实图像特征分成两个分支其中一条分支在聚类特征的特征引导下得到初步分割结果，另一条分支进行目标检测网络，最后检测到的结果与初步分割结果进行融合，利用分割和检测的结果相互促进，得到精确的牙齿分割结果。本发明有效解决小样本牙齿分割的问题，同时利用目标检测和语义分割的各自优势，相互促进相互学习，解决了牙齿分割种类错误以及牙齿边界不精准的问题，能够节省大量的时间成本和人力成本。