本申请属于组学分析方法技术领域，涉及一种脂质组学样本前处理方法及其检测方法和装置，所述方法包括：将加入异丙醇溶剂的实验样本在第一条件下涡旋混匀；将涡旋混匀后的所述实验样本在第二条件下低温离心，以得到所述微量样本的上清液；将所述上清液转移至蛋白沉淀板中；将所述蛋白沉淀板中的所述上清液在第三条件下低温离心，以得到滤液；将所述滤液确定为脂质组学样本。本申请示出的技术方案，通过采用异丙醇单相萃取体系，减少了脂质代谢物在制备过程中的降解，同时在实验过程中加入了蛋白沉淀板的使用，提高了去除蛋白的效率，并引入了自动化工作站提高了实验的重现性和效率。