本发明涉及物质分离纯化技术领域，具体公开了一种制备姜黄素类化合物单体晶体的方法及其应用。本发明的制备姜黄素类化合物单体晶体的方法中，所述姜黄素类化合物单体晶体为双脱甲氧基姜黄素晶体，其包括对原料进行萃取、蒸发结晶和降温结晶的步骤；所述原料为姜黄素单体、脱甲氧基姜黄素和双脱甲氧基姜黄素的混合物，所述萃取不采用层析工艺。该方法得到的双脱甲氧基姜黄素晶体中双脱甲氧基姜黄素含量不低于90％，产品外观为橘红色，晶体晶习为球晶或类球形，粒度均匀；且工艺简单、操作方便，适于工业化生产，产品收率可达到60％以上。