本发明公开了一种沙棘籽油微胶囊的制备工艺及在化妆品中的应用，属于精细化工技术领域。包括以下步骤：将壁材1溶解在水中，加热，得溶液1，所述壁材1为大豆蛋白；将壁材2溶解在水中，加热，得溶液2，所述壁材2为大豆多糖、阿拉伯胶、麦芽糊精中的至少一种；溶液1在均质条件下加入沙棘籽油，继续均质后加入溶液2，继续均质，得乳化液；将步骤(3)所得乳化液干燥，得沙棘籽油微胶囊。本发明所制备的沙棘籽油微胶囊，实现了高包封率，同时延长氧化诱导时间，减少表面油量。