本申请公开了PCIE设备故障处理方法和装置。其中所述方法包括：在BIOS初始化时获取PCIE插槽上的PCIE设备类型信息；根据PCIE设备类型信息，将PCIE插槽对应的IIO端口的DPC功能设置为开启或者关闭；通过DPC处理PCIE设备故障，在PCIE故障出现时，通过BIOS和操作系统的共同作用，使得PCIE链路迅速地断开再重连，由此完成故障的快速恢复，降低PCIE故障导致的宕机，在PCIE故障时仍能保持服务器的正常使用，增强服务器的稳定性。采用这种处理方式，使得有针对性的设置不同PCIE设备对应的IIO端口的DPC功能，避免出现因采用统一设置选项导致的部分PCIE设备断开后无法重连的情况，可以满足不同PCIE设备的故障处理需求。